Лицензия члена организации Охотников дает множество привилегий — возможность бесплатно путешествовать первым классом, доступ к закрытой информации и право брать крупные суммы денег в банках. Ежегодно проводится экзамен, на котором выбираются немногие достойные. Гон Фрикс отправляется на экзамен с целью стать Охотником и найти своего отца.
Майор Мотоко Кусанаги, в детстве перенесшая многочисленные операции по кибернетизации тела и ставшая полноценным киборгом, оказывается под командованием Дайсукэ Арамаки, чтобы расследовать дело о взрыве бомбы. Однако помимо нее Арамаки привлек к делу ветерана и экс-рэйнджера, по чьей вине случилось множество различных кровавых конфликтов в Южной Америке - Бато, и детектива Тогуса. Вместе эта троица должна дать отпор всем террористам.
