Прошло десять лет после героической победы Персея над Кракеном, теперь он живет спокойной жизнью деревенского рыбака и воспитывает 10-летнего сына. Тем временем бушует борьба за превосходство между Богами и Титанами. Ослабленные нехваткой человеческой любви и преданности Боги теряют контроль над заточёнными Титанами и их свирепым лидером Кроносом - отцом правящих братьев Зевса, Аида и Посейдона. Персей не может остаться в стороне, когда Аид вместе с сыном Зевса Аресом заключают сделку с
Город нуждается в героях. Тьма окутала Нью-Йорк в виде Шреддера и его зловещего Клана Футов, у которого имеется железный контроль над всеми, от полицейских до политиков. Будущее выглядит мрачным, пока из канализации не поднимается и не раскрывает своё предназначение четвёрка отверженных братьев - Черепашки-ниндзя. Черепашки должны работать вместе с бесстрашным репортёром Эйприл и её саркастическим оператором Верном Фенвиком, чтобы спасти город и разгадать дьявольский план Шреддера.
